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CBG - Cancer and Brain Genomics - UMR 1245

L'unité Cancer and Brain Genomics a pour objectif d’améliorer le diagnostic et la prise en charge des cancers et des maladies neurologiques en étudiant leur déterminisme génétique et en identifiant des biomarqueurs spécifiques à l’aide d’outils de génomique et « multi-omiques ». Elle compte 5 équipes réparties sur le campus hospitalo-universitaire de Rouen (bâtiment recherche de l’UFR Santé de l'Université de Rouen Normandie, CLCC Henri Becquerel), le CLCC François Baclesse à Caen, l'Université de Caen Normandie, et sur le campus de Mont-Saint-Aignan de l’'Université de Rouen Normandie.

Rapport d'évaluation - Campagne HCERES 2020-2022 (vague B)


MOTS-CLEFS

GENETIQUE

GENOMIQUE, TRANSCRIPTOMIQUE, NEUROSCIENCES, CANCER, BIOINFORMATIQUE, BIOSTATISTIQUES, MODELES CELLULAIRES, MODELES ANIMAUX

ACTIVITES DE RECHERCHE

  • Analyses d’exomes, de génomes, de transcriptomes, et autres analyses « omiques »
  • Cancers héréditaires associés aux mutations constitutionnelles de TP53
  • Héritabilité manquante dans les prédispositions aux cancers
  • Caractérisation des bases génétiques des cancers précoces
  • Contribution des mutations d’épissage aux maladies humaines
  • Caractérisation des bases génétiques des lymphomes
  • Développement et caractérisation, dans les hémopathies malignes et les tumeurs solides, de marqueurs personnalisés du cancer basés sur la détection de l’ADN tumoral circulant par PCR digitale et séquençage de nouvelle génération
  • Caractérisation des bases génétiques de la maladie d’Alzheimer
  • Modélisation de la maladie d’Alzheimer dans les cellules souches
  • Développement dans la drosophile de modèles de maladies neurodégénératives
  • Caractérisation génétique, phénotypique et fonctionnelle des maladies neurogénétiques comme les calcifications cérébrales primaires
  • Caractérisation génétique et signatures épigénétiques dans les maladies du développement
  • Etude des mutations de novo
  • Caractérisation des altérations épigénétiques dues aux exposions anténatales et à l’origine des anomalies du développement cérébral
  • Identification des facteurs de risque génétique conditionnant la survenue de lésions cérébrales chez l’enfant prématuré
  • Caractérisations génétique et épigénétiques des maladies du neurodéveloppement
  • Impact épigénétique d’expositions environnementales sur le développement cérébral
  • Prédispositions génétiques et épigénétiques des lésions cérébrales de l’enfant prématuré, stratégies de neuroprotection
  • Impact du cancer et des thérapies du cancer sur les fonctions cérébrales et cognitives
  • Etudes et Ciblages des altérations génétiques germinales et somatiques dans les tumeurs cérébrales malignes
  • Développement de stratégies innovantes pour le traitement des gliomes de haut grade et modèles animaux pertinents

Equipes

  • Equipe 1 : Prédispositions héréditaires aux cancers
  • Equipe 2 : Génomique et biomarqueurs des lymphomes et des tumeurs solides
  • Equipe 3 : La génomique au service des maladies du cerveau
  • Equipe 4 : Epigénétique et physiopathologie des maladies du neurodéveloppement
  • Equipe 5 : Génétique, biologie, et plasticité des tumeurs cérébrales

KEYWORDS

GENETICS

GENOMICS, NEUROSCIENCES, CANCER, BIOINFORMATICS, BIOSTATISTICS, CELLULAR MODELS, ANIMAL MODELS

RESEARCH ACTIVITIES

  • Exome, genome, transcriptome and other "omics" analyses
  • Hereditary cancers associated with germline mutations in TP53
  • Missing heritability in cancer predisposition
  • Characterization of the genetic bases of early cancers
  • Contribution of splicing mutations to human diseases
  • Characterization of the genetic bases of lymphomas
  • Development and characterization of personalized cancer biomarkers in hematological malignancies and solid tumors based on the detection of circulating tumor DNA by digital PCR and next generation sequencing
  • Characterization of the genetic bases of Alzheimer's disease
  • Modeling Alzheimer's disease using stem cells
  • Development of neurodegenerative disease models in Drosophila
  • Genetic, phenotypic and functional characterization of neurogenetic diseases such as primary brain calcifications
  • Genetic characterization and epigenetic signatures in developmental diseases
  • Study of de novo mutations
  • Characterization of epigenetic alterations due to prenatal exposures associated with brain developmental abnormalities
  • Identification of genetic risk factors conditioning the occurrence of brain lesions in preterm children
  • Genetic and epigenetic characterization of neurodevelopmental diseases
  • Epigenetic impact of environmental exposures on brain development
  • Genetic and epigenetic predispositions of brain lesions in the preterm child, neuroprotection strategies
  • Impact of cancer and cancer therapies on brain and cognitive functions
  • Studies and Targeting of germline and somatic genetic alterations in malignant brain tumors
  • Development of innovative strategies for the treatment of high grade gliomas and relevant animal models

Teams

  • Team 1: Genetic Predisposition to Cancer
  • Team 2: Genomics and Biomarkers of Lymphoma and Solid Tumours
  • Team 3: Genomics for Brain Disorders
  • Team 4: Epigenetics and Pathophysiology of Neurodeveloppemental Disorders
  • Team 5: Genetics, Biology and plasticity of Brain Tumours

PRODUCTION SCIENTIFIQUE

► Publications

Portail HAL : https://hal-normandie-univ.archives-ouvertes.fr/GPMCND


SERVICES

► Equipements

  • Plateformes de séquençage de nouvelle génération : Robots d’extractions d’ADN et de préparation des librairies de NGS, 4 séquenceurs MiSeq et 3 séquenceurs NextSeq 500 (Illumina)
  • Structure informatique connectée au datacenter de l’Université de Rouen Normandie
  • Plate-forme d'hybridation génomique comparative sur puces (CGHarray)
  • Secteur L2 cultures organoïdes, lignées humaines et infection rétrovirale
  • Plateau de transgenèse de drosophiles
  • Plateau d’électrophysiologie et optogénétique
  • Plateau technique d’expérimentation du petit animal (2 postes de microchirurgie, 1 station d’électroporation in utero, 1 station de mesure de l’activité vasculaire cérébrale (laser speckle), 1 station d’analyse de la dysfonction rétinienne (fundus, OCT, ERG), 1 station d’acquisition et d’analyse des vocalises ultrasonores des rongeurs (mère/souriceaux), 3 postes d’analyses des troubles sensorimoteurs du rongeur nouveau-né)

PARTENARIATS

► Adhésion à des réseaux

 

Participation à des consortia internationaux : Alzheimer Disease European Sequencing (coPI), ERN Genturis, International Cancer and Cognition Task Force (ICCTF), COST ERNEST action, i-GPCRnet IRN, etc.

Nombreux réseaux nationaux et adossement à des centres de référence : Association nationale des praticiens de génétique moléculaire (ANPGM), Groupe Génétique et Cancer, Centre National de Référence Malades Alzheimer Jeunes (CNRMAJ), Centre de Référence Maladies Rares anomalies du développement et syndromes malformatifs, Laboratoires de biologie médicale de référence (formes familiales de maladie d’Alzheimer, calcifications cérébrales primaires, déficience intellectuelle, amyotrophie spinale infantile, diagnostic moléculaire du syndrome de Li-Fraumeni, diagnostic moléculaire des prédispositions héréditaires au cancer colorectal), Plan France Médecine Génomique 2025, GIS autisme et TND, Blood and Brain institute, Réseau PériNat, ANOCEF (Onco-neurotox et Gopa), etc.




Adresse Générique :
drv.pole-recherche@univ-rouen.fr
Fiche mise à jour le 08/03/2022

Direction

Gaël NICOLAS

Direction adjointe

Bruno GONZALEZ

Localisation

Rouen (Martainville)

Courriel

inserm.u1245@univ-rouen.fr