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CBSA - Communication Bactérienne et Stratégies Anti-infectieuses - UR 4312

L’unité de recherche CBSA est issue de la fusion du Laboratoire de Microbiologie Signaux et Microenvironnement (LMSM) EA4312 (URN) et de l’équipe Stress-Virulence de l’U2RM EA4655 (UCN) et focalise ses travaux sur le Rôle de la communication et des signaux environnementaux dans l’adaptation, la réponse aux stress et la virulence bactériennes, et le développement de nouvelles stratégies anti-infectieuses. L’UR CBSA s’intéresse aux systèmes de perception et de transduction des signaux de stress et aux différents mécanismes de communication entre bactéries ou entre bactéries et hôte, conduisant à une réponse moléculaire concertée et a l’expression de leur virulence et de la résistance/tolérance aux antibiotiques. Ces processus sont explorés dans plusieurs modèles complémentaires d’interactions hôte-bactérie chez l’homme et la plante. La compréhension des mécanismes moléculaires d’adaptation permettra d’évaluer les risques microbiologiques et de développer de nouvelles stratégies de lutte contre des bactéries pathogènes de l’homme et des plantes.

Rapport d'évaluation - Campagne HCERES 2020-2022 (vague B)


MOTS-CLEFS

SCIENCES DU VIVANT

BACTERIOLOGIE, INTERACTIONS BACTERIES/ CELLULE HOTE, ENDOCRINOLOGIE BACTERIENNE, LUTTE BIOLOGIQUE / BIOCONTROLE, RESEAUX MOLECULAIRES, BIOCHIMIE, BIOLOGIE MOLECULAIRE, OMICS, SANTE

ACTIVITES DE RECHERCHE

  • Enveloppe, Paroi et Membrane bactériennes
  • Mécanismes moléculaires de réponse aux stress biotiques (hormones…) et abiotiques (physico-chimiques, polluants…)
  • Biofilm / virulence
  • Résistance-Tolérance aux antibiotiques
  • Stratégies anti-bactériennes
  • Nouveaux anti-microbiens naturels
  • Agroécologie
  • Microbiote végétal
  • Phytoprotection
  • Biocontrôle
  • Communication inter-bactérienne
  • Communication Hôte-bactéries
  • Microbiote humain
  • Microbiote cutané
  • Microbiote intestinal
  • Microbiote respiratoire
  • Interactions peau-microbiote-cosmétiques
  • Protéomique
  • Lipidomique
  • Métagénomique
  • Transcriptomique
  • Interactomique
  • Perméabilité membranaire

Axes

  • I - Enveloppe et senseurs
  • L’objectif des travaux est de comprendre le rôle de l’enveloppe bactérienne dans son ensemble ou des senseurs bactériens qui lui sont associés dans l’adaptation des bactéries à leur environnement et à leur hôte, la formation de biofilm, et la virulence dans le but de découvrir des composés permettant de modifier cette capacité d’adaptation.

  • II - Communication dans le microbiote humain
  • Les travaux visent à étudier la communication et les interactions entre bactéries et les cellules eucaryotes dans le cas de différents microbiotes (cutané, intestinal et pulmonaire…).

  • III - Communication dans le microbiote végétal
  • Les microorganismes développent avec la plante diverses interactions qui peuvent être exploitées à des fins de protection des cultures (biocontrôle), de l’environnement (bioremédiation, agroécologie) et de santé (qualité et innocuité des aliments). Nos travaux concernent les interactions entre partenaires de la rhizosphère, notamment les communications intercellulaires (quorum sensing) et leurs interférences (quorum quenching), ainsi que les échanges moléculaires via les systèmes de sécrétions de type III et VI.

  • IV - Risques microbiologiques et résistance aux antibiotiques
  • Ce champ porte sur la compréhension des risques associés aux bactéries en étudiant particulièrement la relation entre le métabolisme bactérien et la virulence, le rapport entre la réponse au stress, la résistance aux antibiotiques et les maladies infectieuses, ainsi que le risque microbiologique lié à l’environnement.

  • V - Stratégies anti-infectieuses
  • Les travaux ont pour objectif de proposer de nouvelles stratégies de lutte contre les infections à bactéries multi-résistantes aux antibiotiques, et visent à identifier des molécules ayant des effets anti-résistance, anti-virulence et dans certains cas anti-biofilm.


KEYWORDS

LIFE SCIENCES

BACTERIOLOGY, HOST TO BACTERIA INTERACTIONS, BACTERIAL ENDOCRINOLOGY, BIOLOGICAL CONTROL, MOLECULAR NETWORKS, BIOCHEMISTRY, MOLECULAR BIOLOGY, OMICS, HEALTH

RESEARCH ACTIVITIES

  • Bacterial Envelope, Wall and Membrane
  • Molecular mechanisms of response to biotic (hormones, etc.) and abiotic (physico-chemical, pollutants, etc.) stresses
  • Biofilm / virulence
  • Resistance-Tolerance to antibiotics
  • Anti-bacterial strategies
  • New natural anti-microbial compounds
  • Agroecology
  • Plant microbiota
  • Phytoprotection
  • Biocontrol
  • Inter-bacterial communication
  • Host-bacteria communication
  • Human microbiota
  • Skin microbiota
  • Intestinal microbiota
  • Respiratory microbiota
  • Skin-microbiota-cosmetics interactions
  • Proteomics
  • Lipidomics
  • Metagenomics
  • Transcriptomics
  • Interactomic
  • Membrane permeability

Axis

  • I - Envelope and sensors
  • The objective of the work is to understand the role of the bacterial envelope as a whole or of the bacterial sensors in the adaptation of bacteria to their environment and their host, the formation of biofilm, and virulence, aiming at discovering new compounds able to modify this adaptive capacity.

  • II - Communication in the human microbiota
  • The work aims to study the communication and interactions between bacteria and eukaryotic cells in the case of skin, intestinal and pulmonary microbiota.

  • III - Communication in the plant microbiota
  • Microorganisms develop various interactions with the plant that can be exploited for crop protection (biocontrol), environmental (agroecology, bioremediation) and health (food quality and safety) purposes. Our work deals with interactions between rhizosphere partners, including intercellular communications (quorum sensing) and their interference (quorum quenching), as well as molecular exchanges via type III and VI secretion systems.

  • IV - Microbiological risks and resistance to antibiotics
  • This field focuses on understanding the risks associated with bacteria by studying in particular the relationship between bacterial metabolism and virulence, the connection between the response to stress, resistance to antibiotics and infectious diseases, as well as the microbiological risk linked to the environment.

  • V - Anti-infective strategies
  • The aim of the work is to propose new strategies for combating infections with bacteria that are multi-resistant to antibiotics, and aim to identify molecules with anti-resistance, anti-virulence and, in certain cases, anti-biofilm effects.


PRODUCTION SCIENTIFIQUE

► Publications

Portail HAL : https://hal-normandie-univ.archives-ouvertes.fr/LMSM

► Brevets actifs

  • WO2021018792 - L'OSTEOCRINE, LA LEBETINE OU L'ANP POUR DETRUIRE LES BIOFILMS BACTERIENS

SERVICES

► Equipements

  • Microscopie confocale à balayage Laser
  • Séquenceur ADN NGS 2ème Génération (MiSeq)
  • Séquenceur ADN NGS 3ème Génération (MinION)
  • Robot pipeteur
  • Spectrométrie de Masse MALDI TOF/TOF
  • Extracteur automatisé ADN/ARN QIAcube
  • Système microfluidique d’organ on chips et de flow cell
  • Cytométrie de flux
  • Thermophorèse à Microéchelle
  • Station de Modélisation Moléculaire
  • PCR digitale, qPCR, PCR

PARTENARIATS

► Adhésion à des réseaux




Fiche mise à jour le 08/03/2022

Direction

Sylvie CHEVALIER (URN)

Direction adjointe

Nicolas VERNEUIL (UCN)

Localisation

Evreux/Caen

Courriel

sylvie.chevalier@univ-rouen.fr

Téléphone

02.32.29.15.52

Site web

https://www.lmsm-lab.fr/ (en cours de modification)


Tutelles

Université de Rouen Normandie (UFR sciences et techniques) - Université de Caen Normandie

Fédérations

Institut de Recherche et d'Innovation Biomédicale (IRIB, FED4220)

Normandie Végétal (NORVEGE, FED4277)

Sécurité sanitaire, bien-être et aliments durables (SESAD)

Ecoles doctorales

ED497 - Normande de Biologie Intégrative, santé, environnement (NBISE)